二月，韩代奉贝勒世子命，统满、汉骑步突至安平。郑芝豹、芝鹏等惧兵威，不敢战；敛其众，挈家资、子女于巨舰，弃城出泊外海。成功生母倭妇翁氏手持剑不肯去，强之再四亦不行。大兵至，翁氏毅然拔剑割肚而死。成功闻报，擗踊号哭，缟素飞师前来。而韩代见船只塞海，亦不敢守，弃之同泉。功殓其母，收整城池，与芝豹、芝鹏等守之。
四月，成功复合郑彩、杨耿等众，入海澄，破九都，玫漳平、龙岩等县。孟全胜发都司王玉等进剿，大破之，彩仍遁厦。
德化县未剃发千人，号义师，扶勋西王朱常湷，张存仁檄蔡应科堵截，遣罗成其剿平之。
张振仁遣郡司倪鸿出舟山，招黄斌卿，卿不从。查卿兴化人，遂拘其眷口，交抚院佟国鼎守。令人世舟山，再招之。又接定海总兵张杰报：松江提督吴胜兆交通鲁王作叛情形，星驰与提督田堆提防。
宜春主朱议术从江西逃入汀州，用李芳泰计，结连新建王等众数万，据归化，清源、清源、延平诸邑。守汀总兵于永绶调兵分途堵截，阵斩议术。
七月，鸿逵见成功远去，虞有鞭长莫及，书说成功曰：“凡事当先固本，而后求末。今汝安平弹丸之地，无长江险要可恃。倘韩代率大队复来，一旦反救不及，将奈何？宜速回师，助汝一旅，合攻泉州，暂作安身。然后蓄兵养锐，窥其衅隙，举兵旁掠。”成功令其族叔看守海澄石尾港
八月，从九都回。二十二日，会鸿逵于泉之桃花山，乡绅沈佺期、林乔丹、郭符甲、诸葛斌等相率起兵应之
泉州提督赵国祚，每轻视成功，率骁骑五百、步兵一千五百人，分为两队，一出涂门、一出东门，直冲营垒。成功令洪政、陈新二将统众御之。自辰至午，冲突相拒。鸿逵料不能胜，遣林顺夹攻；功亦令余宽出奇兵截杀，祚兵遂溃。追至城下，鸣金收军。成功每合鸿逵众攻城，成为溜石寨参将解应龙所援。成功请于鸿逵曰：“解应龙在溜石寨作犄角势，此城难玫。叔父可督兵攻城，应龙必来援。侄遣水师一镇桑一筠同杜辉暗袭其寨。另著郭新，余宽暗伏其寨中途，俟彼同救，齐起夹攻，擒之必矣。”鸿逵曰：“可。”随掌号进兵。应龙果来援。至中途，忽流星马飞报“贼玫寨甚紧。”龙即回师，伏起战死。而溜石寨亦为杜辉所破，军声大振。国祚加意防御，日夜巡督。城内已故乡绅郭必昌之子显欲为内应，谋泄。国祚差兵往擒，惟有空室，众骇异。显有爱姬春姊，利显母黄氏珠珥，投国祚乞拣所藏皮箱一，愿首告。国祚许之，遂指后园井中旁石是门。祚令人下扳开，果一大穴，全家在焉，共一十三口，收而杀之。春姊拾皮箱，亦为众所杀；并累及原阁部黄景眆。又西门守将杨义与诸葛斌通为援，适国祚召义守东门，斌不知。是夜率众临城，斌与副将蔡参等全军俱没。祚于是夜禁益严，不敢喘息。功督炮环攻，又令洪政、陈新、余宽、郭泰等领众架云梯齐上。国祚百计御之，不得下。漳州城守王进
成功闻报，见鸿逵曰：“王进接连潮师救援，不日即到。泉郡坚而未易破，倘以一旅扼五陵而攻安平，则首尾受敌。”鸿逵曰：“如此奈何？当且暂退。”成功曰：“安可退师？可令杨才、张进先去莿园守据。林习山与杜辉整备舡只泊浔尾，以防不测。叔父可督林顺、洪政等急攻其城，侄领郭泰、余宽据营五陵，作两边救援。”逵曰：“可。”王进至大盈，侦知各处联营把守，大路不得进，进一时计绌。继探有小路从南安县出发，令遭人夫备草束接应。诈称欲取安平，著杨德功董之。自带马步，乘夜由冷水井过何坑，出南安，突至泉州城下。与洪政战，政败。国祚于城上遥观，知救兵到。以此亦四面呐喊，处作相助势。鸿逵心虚，急遁金门。而成功亦退安平，泉州围解。入城，进见国祚，请救迟罪。祚谢曰：“非公来速，此城危矣！”进恐守成功乘势取漳，即辞祚回师。成功因报鸿逵从浔尾遁，亦就不援。即将杨才等兵抽罔把守五陵要口，自归安平。后侦知王进仅以一千五百人解围，甚追悔。随唤洪政、余宽二将，领兵从小路埋伏青石宫；又令杨才、郭新二将，领兵埋伏莿园；另令张进带兵接应。五将去后，不日回说王进已过二日矣。
本年，总兵李成栋奉命平粤，以李发代之，待傅冠亦如礼。十一月二十一日，冠与发对奕方罢，发阀文书，谓曰：“今部文到，欲收公！”冠欣然起曰；“早毕吾事，公之赐也。”遂整衣冠向南拜曰：“臣负罪无状，死不足赎！”复回向西拜曰：“祖父暴骨，惟冠之辜，羞见先人于泉下！”取笔题壁曰：“白发萧萧已数茎，孽冤何必苦相寻？拼将一副头颅骨，留取千秋不贰心。”掷笔坐地，引颈受刑。令人执刀，无一应者。又悬赏例，亦不忍下。有从征知府李兰友家丁张福出，受赏施刃，以冠首函寄汀州府狱，观者莫不坠泪。是夜悲风震瓦，暴雨涨河。二十二日，家人传国祯负骸广葬于汀之罗，汉岭，与忠诚伯周之藩相对
绍武于前岁十二月在明伦堂购书，被李成栋率轻骑，间道昼伏夜行，砍门而入，绍武逾墙匿王应华家。俄而坠城出，为追骑所杀。苏观生题诗壁上云：“人皆受国恩；时危我独苦。丹心佐两朝，浩气凌千古！”题毕自缢而死
总督佟养甲安民毕，即令李成栋统骑兵到三水。王澄化退守峡口，王坤趋永历西走。式耜奏曰：“土地乃祖宗之土地，守之则可以设计破敌，使英雄志壮。若轻弃而走，不但上负祖宗，且失天下志士之心。”永历不听，遂乘轻舟上西峡而去，从行者惟瞿式耜一人。成栋至肇庆府，进师梧州。永历奔桂林，巡抚曹熠降。瞿式耜请建都设御，令丁魁楚屯兵岑溪。成栋遣人招之，不肯降；乃伏兵与战，矫败退藤江；伏起，魁楚中箭死。成栋挥军逼桂林，王坤请幸楚。式耜请驻全州，疏略曰：“半年之内，三四迁移；兵心民心，无不惶惑。我进一步，人亦进。一步；我去速一日，人来亦速一日。若去而不守，愚者亦共知拱手送人矣。讲以臣留守桂林。”永历允请。李成栋师至，值焦琏自全州来，督兵合御，琏奋勇冲阵，栋方退，桂林得全焉。
成功因攻泉不克，回安平。有原浙江巡抚卢若腾、进士叶翼云、举人陈鼎俱至，谒成功。功待以上宾，每事必咨之。又得海澄人甘辉，身材五短，猛勇绝翼；漳浦人蓝登，武艺精熟；南安人施郎，机略畅晓；与其弟显贵及邱缙、林壮猷、金裕等朝夕操演部伍阵法。并令堆积粮饷于安平
顺治五年
百姓知文武弃城去，天曙，迎成功入城。功出令安民，不许骚扰，民赖以安。功以叶翼云为同安知县，劝谕追征，以助军需。陈鼎为教谕，传告诸生，起义勤王。忽报辅明侯林察自广东逃回，因与苏观生等共立绍武，曾御永历于三水，后共镇虎门。广东破，不敢归永历，仍回闽见成功，详陈瞿式耜等拥立桂王始末。成功加额曰：“吾有君矣！”遂设香案望南而拜，尊其朔号。即修表，遣原隆武中书舍人江于灿、黄志高二人从海道入广称贺，并条陈时势。即以邱缙、林壮猷、金作裕三将守同安，自领大队舟师至铜山，候永历旨，以便会合恢复。
提督赵国祚知同安陷，飞报总督转题。奉旨遣佟鼐、李率泰，陈锦三大人督师恢复各处地方。七月初三它，檄到。邱缙等闻报，即与叶翼云、陈鼎议战守策，翼云曰：“今新君登极，我藩主志存勤王，叫以一城托我等，自当竭力御守。邱、林二蒋军可督兵守大盈岭，以扼泉师。金将军守苧溪岭？以扼漳师。翼云等督民兵守城。一面通知本爵
八月，成功在铜山，整顿船只，训练士卒，候广西永历信到。忽接叶、陈、邱、林告急请援文，即整大队舟师回救。奈北风盛发，难以驾驶，五日方抵金门。侦报同安已破，诸将战死，叶、陈不屈被杀，全城屠戮。功痛哭遥祭，情动三军，遂移师镇海、铜山。漳浦守将王起俸谋降，事泄，弃家从旧镇入铜山；成功受降，加俸总练使，同柯宸枢联络铜山等处，募兵措饷；诏安县五都八林日灼鼓众拒之。功令甘辉往征，日灼旋灭。
十月，江子灿、黄志高同太监刘玉赍永历诏到，晋封成功威远侯。功拜受毕，厚待刘王。遂兴师从云霄白塔登岸。守云霄将张国柱迎战，被施显贵所杀。遂率众攻城。中军守备姚国泰拒守。城陷，国泰巷战，重伤被擒。功惜其忠勇，令医治，用为监督。
粤东原大学士陈子壮、兵科给事中陈邦彦同起兵，船千艘，合攻广东。因故指挥杨可观、杨景烨为内应，谋泄被杀，悬首城上。邦彦战死。子壮遁据高明，遣家人陈荣赍书赴成功处请救。又原兵部侍郎张家玉，会故南海指挥安弘猷、训导张治亦起兵袭东莞县，杀典史张元鼎，知县郑鋈自缢。李成栋闻报，率兵至，击斩安弘猷。家玉走龙门纠众，遣闽将杨可梁亦赍家书至。成功部整师欲从虎门入援。至靖海，闻二家俱遭难，乃止
李成栋奉总督佟养甲令，提师攻桂林。后合平南、定南、清南三藩劲旅，直趋武冈。刘承胤令其弟承祖辅永历从间道奔靖州。大学士吴炳被执，不屈二。三藩围武冈？折矢招承胤，胤举城降。部议以其放永历西去，杀之。永历自靖州奔柳州，得何腾蛟、郝永忠、卢鼎兵俱至防御，始安。佟养甲督兵攻全州，何腾蛟率焦琏、郝永忠、卢鼎合滇师赵印选、胡一清分道夹攻，养甲遁。
永历仍还桂林，诸师不和，兵哗争构衅。成栋侦知，乘虚潜师至北门。式耜守城，腾蛟召诸将合凿，栋方退师。栋负平粤有功，而耻受制于总督。偶演戏，其妻张氏见而笑焉。张氏系陈子壮之妾，成栋抄某家，见张氏美丽遂娶之。相从年馀，未见欢颜；今日之喜，必有由也。栋诘之，氏曰：“为见台上威仪，触目相感。”栋令人取冠服自穿，氏起取镜照之。栋跃起曰：“真威仪可观也！”遂萌反念。密属标兵哗索粮饷，齐集教场，然后请养甲出城抚辑。甲不知是计，同栋行。甫坐下，众兵鼓噪，同时剪辫，即飞书通粤西。巡抚耿献忠亦剪辫，江西提督金声桓同副将王得仁杀童巡抚，剪辫反，应之，共尊永历朔。声桓、得仁咸是左良玉部将，李成栋隶高杰标下，且交好，故片纸至却从。永历命兵部侍郎万翔、兵部职方司揭重熙监局铸印，封成栋惠国公、养甲襄平伯、声桓豫国公、得仁建武侯、献忠两广总督。成栋遣原翰林院检讨蔡之俊赍表前往桂林，请驾幸粤。永历下廷臣会议，未定。瞿式耜疏言有云：“驾若东幸，军中将帅谓朝廷乐新复之土；而成栋亦有邀驾之嫌。号令既远，人心涣取，臣恐不能制也。”遂不果行。之俊还报成栋，栋具疏再请曰：“天下乃太祖之天下。今日光复旧业，何为乐新土？陛下若欲中兴，须亲统六师，行间指挥，俾诸将士奋勇戮力；四方咸知有君，自当响应。岂可偏安粤西，优游度日，令天下豪杰寒心乎？此臣鳃鲤至计，非冀邀驾之功。”遂令原给事蒙正发，再往南靖请驾。永历方至肇庆，李成栋率文武跪接如礼。永历抚成栋背曰：“扶今日中兴，全赖卿力，决不吝分茅列土之封。”栋叩首曰：“军旅之事，毋烦陛下深忧，臣自当竭力前进。第运筹帷喔，策应粮饷，岂可乏人？必须元老方可，讲召翟式耜。”永历允奏，随加成栋子李元胤为锦衣卫指挥使，提督禁旅。栋复上疏，速当发诏通成功，连兵恢复。召式耜使者三四去，而式耜固辞；且连上五疏乞休，不允。成栋无奈，陛辞回粤，出师。诏至厦门，成功拜接，遂大整军伍，今芝莞统舟师从虎头门进。
顺冶六年己丑
顺治七年庚寅
三月，以施郎为左先锋镇、弟显贵为右先锋镇、黄廷为援剿右镇、王秀奇戎旗镇、甘辉亲丁镇。
四月，成功复至揭阳，攻新埠寨。寨长乞输饷，许之。
五月，诏安九甲万礼从施郎招，领众数千来归
六月，成功引舟师击苏利，风逆，反师围潮州。陈斌烧断广济桥，日夜攻击。尚久死守，乞救于漳镇王邦俊。俊亦奉恢复浦、诏檄，随统大队骑步至长桥，把守罗山岭。黄廷、洪政不战弃城遁。俊安民毕，侦知守盘陀贼众，据险扼守，不得进。邦俊以骑兵往来诱敌，令副将王之刚从盘龙小路度岭，又令游击张胜由杜浔而过云霄，合围攻击。宸枢分头迎战，至炮矢尽，全军皆没。邦俊复云、诏，进师黄冈。成功得报，不恨浦、诏之失，大伤宸枢之亡。知救援至，遂退潮阳。黄亮未乘虚同陈拔五、李英等叛攻行营。甘辉迎击，斩彩父子与拔五等，方定。
八月，芝鹏至潮阳，说成功取厦门为家。成功曰：“彼船只倍多，部将老练。取之不得，反结为仇。”芝莞曰：“建国
苏利侦知功航船回厦，率众攻破惠来。守将卢爵战死，知县汪汇不屈自刎。成功差洪政招闽安、铜山、南澳诸岛，咸听约束。功以辅明侯林察为左军、闽安侯周瑞为右军、定西侯张明振为前军、平彝侯周鹤芝为后军，自为中军元帅，用蔡福为内司中军镇。每军大小船一百号，凡有原镇各分隶之。泉州人冯澄世
十一月，至潮阳。时施郎与陈斌不睦，功因未进师。有首黄海如通尚可喜，成功遣林习山袭杀之，宥其馀党，分配各镇，一时乃安。
顺治八年辛卯
二月，成功引舟师至白沙湖，遇暴风。收入盐州港。擢蔡进福为内司水师镇，旋举为水师右镇。
三月，至大星所，杀败惠州援兵，攻其域，下之。时福建巡抚张学圣按泉郡，侦知成功往粤束，立咨驻泉中路总兵马得功，统兵乘虚袭厦门。得功随统辖骑兵，先从五通渡过。水师镇阮引不战而遁。芝莞闻报，席卷珍宝，弃城下船。岛中鼎沸，成功妻董氏怀神主出，步行海滨，见船仔招之曰：“我董夫人也！”舵工林礼泊岸，背夫人落船。夫人曰：“那只船是莞爷的？”礼指以重载者是。夫人令泊其船。芝莞见夫人，忙请曰：“此战舰也，不便居。请夫人到家眷船中，有人伏伺。”夫人知此船系芝莞积藏，识破机关；乃曰：“媳妇喜乘此船。今战征时侯，非此不可”，莞再三相强，夫人坐而不动，得功领五百馀骑往来驰骋，百姓奔窜石洞。原阁部曾樱，人劝其出遁。樱笑曰：“吾今日犹得正命清波，幸也！遁何处？”自缢死
张学圣与兴泉道黄澍、原同安县张效龄督大队至，适潮大涨，遂登五通山。一望波涛万顷，而岛屿孤悬海外，险地也。顾哗澍曰：“此乃绝地，我若过去，船只不继，缓急岂能飞渡？实用兵之忌”即下山，引师返。得功知后军已退，不敢坐镇，走实当港，遇郑鸿逵将杨杼素、吴渤与战。得功奋勇，射死吴渤，杼素不敢迫。施郎闻知，率陈埙、郑文星等从厦门港登岸追赶至，得功战少怯。计穷，遣人驾小船见鸿逵曰：“虽彼此间隔，各尽其职；然亦无时不悬念公也。今得功奉令过岛，未曾扰一草一木。奈欲退无舟可渡，得功必死于此。得功死；分所当然；，但恐此岛人民万不能全耳。且公兄在京，眷口在安平，其能安乎？不如宽得功片刻，假渡而归。一举两得，得功幸甚，即公亦幸甚。乞熟思之！”鸿逵动昔日之情，亦以为然，放松高崎守，假渔船数只，渡得功回泉
当得功渡厦时，都督郑德、副将周王臣坐快哨，飞奔大星报成功。功即率大队舟师于四月初一日到厦门，计得功已去五日矣。成功大愤鸿逵卖情，令一应镇将下许赴鸿逵衙署，逵遂移师出屯金门之白沙。成功亲历各要口，亲祭阁部会樱。改厦门为思明州，以郑擎柱为思明知州。督民去筑炮台数处，拨劲旅防守。将董氏所乘芝莞船积榈金银，搬充军饷。
初十日，成功大会文武，议厦门芽罪。赏施郎银二百两，陈埙、郑文星银各一百两。芝莞以失机论罪当斩。莞欲辩；而成功已冠带请旨，出隆武所赐尚方剑，斩莞示众。诸将悚然。顷献首阶下，功令悬之街三日，方许收葬。并有“本藩铁面无情。尔诸勋臣镇将，各宜努力。苟不前进怯敌，本藩自有国法在；虽期服之亲，亦难有之。”谕阮引、何德各捆责五十，蓝登姑宽其罪立功。吴勃遣知州致祭，厚恤其家。于是众军股栗，无敢犯。
鸿逵在金门，见成功举动威严，执法无私，亦将船只悉付之。择白沙地方筑寨，广构亭沼，艺植花木，额曰‘华觉’；笙歌唱娱
五月，成功见布置得宜，将师移于金门之后浦，操演阵伍，整顿船只，以俟兴师。
七月，太监刘九皋赍永历诏航海至，成功跪接。宣读请安毕，询帝行在，方知驻跸浔州。九皋又说：“去岁曹志建战败，新虎关失守；马进忠又战败于瓜里，师退武冈州，桂林大震。督师于元华、滇镇赵邦选、胡一清、焦琏在平乐，怀私情，按兵不前，以致全州不能守，严关亦失。十月，宁远伯王永祚与胡一清俱乏饷，入桂林，榕江一带咸室壁。留守瞿式耜，命赵邦选出城御敌，选不遵，再促之，挈家去。杨国栋、马赛麟出小路，兵溃，一清亦奔窜。独式耜危坐署中，总兵戚良勋率五骑至，劝式耜速出，再图后举，耜不允；曰：“汝去！汝去！我去不过多活几日。自古及今谁不死？”挥良勋出。总督张同敝亦自灵州逃回，闻城空？惟留守在，入见式耜，曰：“将奈何？”耜应以“封疆之臣，当死封疆，子无留守责；盖去诸！”同敝愿同死。耜回顾左右，惟一老兵而已。令老兵于城上召中军徐高入，将劾印付之，令驰行在。遂张灯取酒，相向而饮。天微曙，数骑至，执耜与同敝去见定南王孔有德。德举手问：“谁是瞿老先生？”耜曰：“余是也。欲何为？城既陷，惟求一死。”德曰：“吾断不杀忠臣，先生何自苦？”耜曰：“天朝大臣，岂你所可说乎？”，德曰：“本藩亦先圣苗裔，天命所在，岂有逆乎？”同敝厉声曰：“你不过毛文龙下走耳，毋辱先圣！”德大怒，喝左右称之。耜曰：“此官詹司马张同敞，不可辱！”德笑而释之，还其衣冠。二人坚讲死，德令暂出别居，遣官劝之薙发，二人不屈。又令为僧；曰：“为僧乃薙发之渐。发短命长，不为也。”绝粒。十一月十七日，受刑
左先锋施郎从将曾德犯法当死，脱逃赂匿成功左右，郎侦擒之。功驰令勿杀。郎曰：“法者非郎敢私，犯法安能逃？使藩主自徇某法，则国乱矣。”促令杀之。但持令者乃德挚友，回而不述执法前言，徒诡说“尔欲以藩令胁吾，面叱杀之”之语。成功大怒。次日，传诸将入船，令右先锋黄廷收郎，并父大宣、弟显贵，交林习山守于巨舰。习山令副将吴芳看之。是晚有到船访郎者。曰：“命不保矣，随登岸去。”郎急谓显贵曰；“危在旦夕，兄弟岂可俱毙？弟年壮，速当计脱！”贵曰：“兄雄略胜弟十倍。且我有子，兄尚无嗣才吾与父当之，兄急行，勿多语，恐有漏泄。”郎起，佯喜语吴芳曰：“吾以藩主欲杀我，谁知欲令我备铠甲。此易事也。”取酒与芳欢饮毕，恳芳曰：“伴我登岸，往见当事。”芳见郎举动雀跃，又以父与弟在船，遂信焉。令人随之登岸。郎曰：“大路恐遇人不便，由小径行。”芳之随者是之。至草仔垵，郎出铁锥锥死芳之伴者三人，走匿曾厝坡石洞中。是晚，成功闻报大怒，捆林习山欲杀。拘吴芳妻子，令芳侦寻赎罪。二十一日出令，收大宣、显贵，斩之。严禁船只，晓谕搜索。郎匿数日，饥饿难当，乘昏，奔其部属左营苏茂署
五月；成功擢戎旗中协林胜为援剿右镇。整大队，领中提督甘辉，左先锋镇苏茂，中冲镇蓝登、宣毅左镇杜辉、援剿后镇陈魁、左冲镇郭义、右冲镇蔡禄，后冲镇林明、前冲镇统领余新、奇兵镇杨祖、智武镇蓝衍等，从南溪登岸。漳州总兵王邦俊率骑兵一千，步兵二千，列阵于磁灶以待。杜辉、蓝登奋勇夺先，卒众用藤牌厝抵箭迎敌。骑兵不能胜，矢将尽，少却。余新、杨祖出左。蔡禄、陈魁出右，合击。邦俊势孤，遂溃，入城坚闭不出。
六月，成功回厦。旧将黄兴投见，授兴中权镇。平和人黄梧来归，即授副将。以监督陈六御为北镇，管骑兵。
九月，成功复率众入攻漳浦。王邦俊来援，被甘辉所败，追至马口始收军。提督杨名高接王邦俊‘海逆猖獗’报，统兴、泉各镇营进剿。成功侦知，令蓝衍、杜辉为先锋，以苏茂、郭义私过小盈岭之左埋伏，杨祖、蔡禄衔枚伏于小额岭之右，听号炮三声，各抄出夹攻，使彼首尾受敌。又令甘辉、余新为监阵接获，陈魁、黄梧为救援。自领林明、刘巧、林胜等，登山顶观战。名高知成功兵屯小盈岭，即以骑兵五百为先锋，分步兵三千为二队以应之；又以骑兵六百作二队，为左右救援；自领骑步三千迎战。时冬十一月，天气严寒，名高谓诸将曰：“海贼赤脚，可乘今日冻栗击之。”遂进，遇于岭下，两相交锋，胜负未分。成功令林明发炮。明连发三炮，而杨祖冲出。高分兵接御，苏茂、郭义从后抄杀。高队大乱，死者甚多。名高退同泉州。
十二月，成功乘胜旁掠诸县。漳浦守将杨世德、陈尧策